企業(yè)車輛違章處理流程包括以下步驟：

1、首先，公司需要準備必要的證件復印件，包括違章車輛所屬公司的委托書、營業(yè)執(zhí)照和代碼證等，并蓋上公章。這是進行公司違章車輛繳費的必要條件。

2、在處理違章時，企業(yè)可以選擇全部處理或有選擇地處理，并有權對違章提出異議并申請行政復議。

3、如果企業(yè)對于違章沒有異議，處理完駕駛證扣分后，將會獲得違章處理通知書和罰款單。接下來，企業(yè)需要前往指定的繳款銀行（如工商銀行、建設銀行、農村信用社等）進行罰款繳納。

4、完成罰款繳納后，請務必妥善保管好罰款繳納后的回執(zhí)單。如果違章記錄仍然存在，企業(yè)需要攜帶回執(zhí)單前往交警部門手動清除違章。